В далеком будущем Земля и ее обитатели попали в когти враждебной империи Иллюмидус. Капитан Харлок, командующий космическим крейсером "Призрачная смерть", сражается против захватчиков и помогает беженцам. Но даже он не может справиться с тиранией внеземных захватчиков и сталкивается с поражением. После нападения оккупационных сил Харлок вынужден совершить посадку на захваченной врагами базе Земли.

На базе, под контролем Иллюмидуса, Харлок знакомится с Тотиро Ояму, который представляет ему свое удивительное творение - линкор "Аркадия". Он создал его, используя потерянные технологии своих предков, и назвал в честь родины благородного клана пиратов-рыцарей Харлоков. Тотиро Ояму становится верным союзником Харлока в его стремлении освободить Землю и человечество от поработителей.

Капитан Харлок, последний наследник древнего клана пиратов-рыцарей, начинает свой героический путь, чтобы вернуть свободу Земле и спасти человечество. Он готов противостоять Иллюмидусу и принять вызов судьбы, ведь на его плечах лежит ответственность за судьбу всего мира. Вперед, к новым приключениям и битвам, где на кону стоит выживание и свобода!