Действие этого захватывающего аниме разворачивается в далеком будущем, в 2071 году, всего за несколько дней до праздника Хэллоуин. Марс, столица колонизированной красной планеты, стал свидетелем страшного события - выпуска смертельного вируса. Власти обещают огромную награду в размере трехсот миллионов вулонгов (₩) тому, кто сможет разоблачить тех, кто стоит за этим безжалостным актом. Награда стала самой великой в истории, и за нею охотятся не только наш главный герой Спайк Шпигель и его команда на космическом корабле Бибоп, но и многие другие жаждущие богатства и правды люди.

Но в центре внимания оказывается загадочный Винсент Воладзю, чья ответственность за ужасные события на Марсе вызывает еще больше вопросов, чем можно было предположить. И чтобы разобраться в этой запутанной истории, на его поимку отправляется агент Электра Овило, которая помимо этого также должна заботиться о тех, кто может пролить свет на происшедшее. Впереди их ждут опасные приключения и неизвестность, но вопрос остается: как поймать человека, у которого нет ни прошлого, ни будущего?

Судьба Марса теперь полностью зависит от доблестного экипажа космического корабля Бибопа! Спайк, Фэй, Джет, Эдвард и Эйн должны объединить свои силы и умения, чтобы справиться с множеством опасностей и раскрыть тайны, скрывающиеся за вспышкой вируса. Их путь будет трудным и полным испытаний, но только они способны найти истину и вернуть мир и спокойствие на Марсе. Готовы ли они пожертвовать своими жизнями ради общего блага? Это вопрос, на который они должны найти ответ в самом сердце опасности и хаоса.