Человечество снова понесло потери. В сердце Харуо теперь пробуждается сомнение, что станет следующим шагом в борьбе за выживание. Маина и Миана, несущие предостережение в отношении загадочного Метфиса, стали свидетелями его преобразования после победы Харуо. Теперь Метфис, проповедуя о своей "конечной цели", привлекает последователей и вызывает сомнения в сердцах выживших.

Но человечество оказалось безоружным перед Годзиллой, и у тех, кто выжил, нет ничего, кроме возможности наблюдать, как на их планету спускается новый ужас - Король Гидора. Это крылатое существо, излучающее золотой свет, переносит войну на новый уровень и заставляет Землю содрогнуться вновь.

Что же на самом деле скрывается за историей Годзиллы? Существует ли шанс для человечества? Сможет ли Харуо, смотря в будущее своими глазами, найти ответы на эти вопросы и проложить путь к спасению?