После окончания Второй мировой войны в Японии была создана секретная агентство, чья миссия заключается в борьбе с терроризмом и экстремизмом. Это нелегкая и ответственная задача, которую выполняют только профессионалы. И удивительно, что эти профессионалы - ниндзя. Первоначально организация работала только в Японии, но спустя несколько лет она стала международным агентством. Ниндзя занимались операциями не только на местном, но и на мировом уровне. Количество сотрудников организации по всему миру достигло двадцати тысяч человек.

Один из сотрудников - главный герой, молодой парень по имени Кудо. Он учится в старшей школе и на момент присоединения к агентству ему было всего семнадцать лет. Кудо не слишком удачлив, но он прилагает все усилия, чтобы стать одним из лучших ниндзя. Ему не хватает дружбы и поддержки, а интенсивные тренировки выматывают его. Тем не менее, его мечта осуществима, но он не должен забывать о школе и домашних обязанностях. Поэтому главный герой работает неполный рабочий день и не может полноценно сосредоточиться на своей работе.

В ходе своей службы Кудо сталкивается с различными опасностями и трудностями. Он вынужден противостоять интригам, предательству и своим собственным страхам. Но он также находит верных друзей и наставников, которые помогают ему в его пути к успеху. Кудо понимает, что чтобы достичь своей цели, ему придется преодолеть множество препятствий и ни на секунду не ослаблять свои усилия. Ведь его задача - защитить мир от зла и стать настоящим героем.