Прошло три года с тех пор, как "избранные" спасли цифровой мир от зла. Дети повзрослели, а то, что когда-то происходило, забылось. Но судьба решила, что новому поколению "избранных" предстоит вновь встать на защиту мира. Ведь в самый неподходящий момент объявился новый враг - Император Дигимонов. Он не только унижает дигимонов, но и использует их в своих темных умыслах.

Чтобы справиться с этим вызовом, были выбраны три новых ребенка - Дайсукэ Мотомия, Иори Хида и Мияко Иноуэ. Они получили свои дигивайсы и собственных дигимонов, ставших их верными спутниками. Теперь перед ними открылось новое приключение, полное опасностей и испытаний.

Молодые герои отправляются в путешествие по земле дигимонов, где им предстоит сразиться с Императором Дигимонов и его армией подчиненных. Они должны найти в себе силу и мудрость, чтобы защитить своих друзей и спасти цифровой мир от разрушения. Вместе с их дигимонами они сражаются с врагами, преодолевают трудности и находят новых союзников, чтобы восстановить мир и гармонию в дигитальном пространстве.