События 11-ого фильма разворачиваются на таинственном острове Коми в Тихом океане. Этот остров уже несколько поколений передает легенду о загадочном "Подводном дворце", древних руинах, спрятанных на дне моря. Именно здесь, по легенде, хранятся сокровища двух женщин-пиратов, Энн Бонни и Мэри Рид, которые жили 300 лет назад. Легенда привлекает внимание многих, и во время отпуска на острове Коми Когоро, Конан, Ран и их друзья, составляющие "Команду юных детективов", встречают группу охотников за сокровищами, готовых пойти на все ради драгоценностей.

Очень скоро наши герои оказываются втянутыми в серию загадочных преступлений и захватывающие поиски спрятанных сокровищ. Вместе с охотниками за сокровищами они погружаются в опасные подводные пещеры, исследуют таинственные карты и расшифровывают старинные знаки, пытаясь раскрыть тайну "Подводного дворца". Но каждый шаг приближает их не только к сокровищам, но и к разгадке древней загадки, которая может изменить их представление о прошлом и перевернуть их мир с ног на голову.

В то время как группа друзей продолжает свои приключения, они сталкиваются с предательством, интригами и ожесточенной борьбой за власть. С каждым новым открытием растет напряжение, и наши герои понимают, что они не только ищут сокровища, но и борются за свои жизни. В их руках судьба вековой тайны и, возможно, судьба самого острова Коми.