Прошло два года с тех пор, как последняя схватка с фестумами потрясла остров Тацумия. Жители медленно, но верно возвращаются к своей обычной жизни. Однако Кадзуки Макабэ, потерявший зрение, все больше теряет веру в обещание Соси Минасиро о возвращении и восстановлении старого порядка. Его вера будет испытана, когда на берегу острова появляется загадочная подводная лодка.

На борту лодки находится таинственный юноша по имени Мисао Курусу, который утверждает, что его послал сам Соси. С появлением Мисао возрождается вражда между фестумами и людьми. Кадзуки и остальные пилоты фафниров вынуждены вновь вступить в битву с прежним врагом. Однако на этот раз ставки намного выше, ведь это решающая схватка, которая определит будущее человечества и фестумов.

Судьба людей и фестумов висит на волоске. Кадзуки и его команда должны преодолеть свои сомнения и бороться до последней капли силы. Они готовы пожертвовать всем, чтобы защитить свой остров и спасти человечество от ужаса фестумов. Впереди их ждет самая тяжелая и важная битва в жизни, которая принесет либо спасение, либо полное уничтожение.