В недалеком прошлом огромное землетрясение привело к разрушению большей части Японии и полному уничтожению Токио, погрузив треть города под воду. События этой истории разворачиваются спустя 10 лет, когда мы знакомимся с Гантой Игараши - обычным парнем, учеником средней школы в префектуре Нагано. Он выжил в том ужасном землетрясении, но потерял память о происшедшем и продолжает жить спокойной и нормальной жизнью.

Однако все меняется в тот день, когда в класс Ганты влетает загадочный человек, окровавленный и с безумной ухмылкой на лице. Он жестоко убивает всех в классе, но вместо того, чтобы уничтожить и Ганту, он вонзает в грудь парня красный осколок кристалла. После этого события жизнь Ганты переворачивается с ног на голову.

Через несколько дней после этой жестокой резни Ганта оказывается единственным подозреваемым. Его быстро приговаривают к пожизненному заключению в "Стране чудес смертников" или "Deadman Wonderland" - частной тюрьме, по своей атмосфере больше похожей на парк развлечений. Здесь заключенные, известные как "Мертвяки", вынуждены участвовать в смертельных играх и исполнять различные задания для развлечения общества. Ганта сталкивается с жестокостью и безжалостностью этого места, в то время как он пытается раскрыть тайну своего кристалла и найти ответы на свои вопросы.