В мире, идущем в ногу с технологическим прогрессом, квантовые компьютеры стали частью повседневной жизни. Люди переносят свое сознание в кибер-пространство, где им открываются новые возможности. Одна из таких людей - Шики, сестра главной героини Рэму. Всего лишь 14-летняя Шики бежит из дома и поступает в престижную старшую школу «Плавучий Остров-Мегаполис Окинотори». Там она общается с Рэму прямо из кибер-пространства, находясь при этом в специальной капсуле с жидкостью, называемой «боди-пул».

Рэму была потрясена откровением Шики, но не осуждала ее выбор. Однако все меняется, когда на Плавучем Острове-Мегаполисе Окинотори происходит «Короткое замыкание». Сетевой сервер, не выдержавший нагрузку, запутывает сознания пользователей в кибер-пространстве, оставляя их тела бездушными в боди-пулах. Рэму, с целью помочь сестре, отправляется в ее квартиру, где обнаруживает Шики. Но она утверждает, что потеряла память и не уверена, что тело, которое она занимает, принадлежит ей на самом деле. В то время, как Рэму пытается осмыслить происходящее, их квартиру внезапно нападают...

Рэму и Шики оказываются втянутыми в опасную ситуацию, где им приходится бороться за свою жизнь. Они понимают, что за коротким замыканием стоит нечто намного большее, чем просто техническая неисправность. По мере того как они раскрывают тайны Плавучего Острова-Мегаполиса Окинотори, им предстоит столкнуться с неизвестными врагами и исследовать свои собственные истинные идентичности. В этом путешествии они узнают, что даже в мире, где реальность и виртуальность сливаются воедино, самые ценные вещи - это связи, которые мы создаем с другими людьми, и наше стремление найти свое место в этом мире.