15 июля 2043 года на рынок вышла новая игра Infinite Dendrogram, предлагающая полное погружение в виртуальный мир. Она была оснащена уникальной системой Embryo, которая позволяла игрокам исследовать бесконечное количество вариантов развития. Такое техническое достижение виртуальной реальности стало событием мирового масштаба.

Через два года после успешной сдачи вступительных экзаменов в Токийский университет, Рэйдзи Мукудори начинает свою одинокую жизнь в большом городе. После долгой и утомительной подготовки к экзаменам он решает отметить это событие и окунуться в мир Infinite Dendrogram, куда его давно приглашал его старший брат Сюити.

В этом виртуальном мире Рэйдзи встречает много интересных персонажей и начинает свое приключение. Он погружается в захватывающие сражения и знакомится с различными стилями игры. Вместе с новыми друзьями и союзниками он исследует бескрайний мир Infinite Dendrogram, полный загадок и секретов. Новые возможности и опасности ждут его на каждом шагу.