Аниме-адаптация MMORPG "Phantasy Star Online 2", охватывающая события с первого по третий эпизоды, с уникальным материалом, созданным специально для этой адаптации.

Группа выпускников спецподразделения ARKS отправляется на планету Набериус, чтобы пройти главный экзамен. Однако, в самом начале миссии, отряд оказывается атакован агрессивными инопланетными существами, известными как даркеры. Им удалось отбиться и выжить, их главный герой Эш и его напарник Афина находят убежище в глубинах лесов планеты.

В лесу они встречают девушку, потерявшую память, и загадочного незнакомца, который стремится убить ее по неизвестным причинам. Главному герою предстоит раскрыть тайны повышения активности даркеров, связь с загадочной девушкой и истинные мотивы, стоящие за созданием спецподразделения ARKS.