Жизнь Такаши Нацумэ продолжает быть связанной с тесными взаимоотношениями с людьми и ёкаями. Но однажды он встречает своего старого друга Юки, и это воссоединение пробуждает у него болезненные воспоминания о прошлом. Однако встреча с Йориэ Цумурой, подругой его бабушки, помогает Нацумэу не только узнать много нового, но и забыть о мучительном прошлом.

Но их приятное общение нарушается появлением ёкая из прошлого. В саду семьи Фудживара случайно попадает таинственное семя ёкая, которое ночью превращается в фруктовое дерево. Нянко случайно съедает один из плодов этого дерева, и тут же телохранитель Нацумэа рассыпается на трое!

Так начинается новое приключение для Нацумэа и его друзей. Они должны разгадать загадку фруктового дерева и найти способ вернуть телохранителя в его прежнюю форму. Под руководством Йориэ они отправляются в опасное путешествие по миру ёкаев, где им предстоит столкнуться с множеством опасностей и раскрыть тайны своего прошлого.