Кён — обыкновенный японский школьник, который уже давно потерял веру во все, что выходит за рамки привычного. Но все меняется, когда он знакомится с одноклассницей Судзумией Харухи. Оказывается, что среди нас существуют пришельцы из будущего, инопланетяне и даже экстрасенсы, и все они скрывают свою истинную природу, притворяясь обычными школьниками! Все началось с недовольства Харухи отсутствием интересных клубов в школе, и тут Кён пришел к выводу, что если нужного клуба нет, то можно создать свой собственный. И так появляется Бригада SOS — клуб по поиску и изучению паранормального.

Первым членом клуба становится Кён, который, на самом деле, единственное, чего хочет, это чтобы Харухи оставила его в покое. Их квартира становится базой операций клуба, и там они встречают Юки Нагато, инопланетянку, которая вступает в клуб по приглашению Харухи. Но им нужно больше членов, чтобы полностью составить команду. Их следующим приобретением становится Микуру Асахина, путешественница во времени, которая вступает в клуб не совсем добровольно. И наконец, чтобы полностью закончить команду, им нужен таинственный незнакомец, который появляется из ниоткуда и имеет свои собственные скрытые цели. Наконец-то они находят Ицки Коидзуми, экстрасенса, который переводится в их школу.

Теперь, когда команда полностью собрана, они готовы начать поиски неведомого. Бригада SOS исследует паранормальные явления, разгадывает загадки и сталкивается с самыми разными существами. Каждый из членов клуба имеет свои собственные тайны и способности, и вместе они образуют непобедимую команду, готовую преодолеть любые преграды. Но, конечно же, у них не обходится без неприятностей и внутренних конфликтов. Их приключения полны юмора, драмы и неожиданных поворотов событий, которые заставят зрителя оставаться на грани своего кресла и ждать каждую новую серию с нетерпением.