Ремейк популярного аниме-сериала "Стальной алхимик" 2003 года, теперь более точно следующий за сюжетом манги. В этом удивительном мире существуют алхимики - люди, обладающие навыками алхимии, искусством манипулирования материей и трансмутации веществ. Они подчинены основному Закону алхимии: нельзя получить что-то алхимическим путем, не отдав что-то равноценное взамен. Единственный способ обойти этот Закон - это обладание философским камнем, легендарным артефактом, процесс создания которого давно утерян.

Главными героями являются братья Эдвард и Альфонс Элрики, которые в детстве попытались вернуть свою мать к жизни, но заплатили высокую цену. Они забыли об основном Законе алхимии и стали жестоко наказаны: Альфонс потерял свое тело, а Эдвард - руку и ногу. Однако Эдвард смог спасти душу Альфонса, запечатав ее в старинных доспехах.

Спустя много лет Эдвард успешно сдаёт государственный экзамен на звание алхимика и получает прозвище "Стальной Алхимик". Братья отправляются в путешествие с целью найти философский камень и, надеясь на его помощь, восстановить все, что им было отнято много лет назад. Впереди их ждут опасности, загадки и встречи с различными алхимиками, которые помогут им раскрыть тайны этого удивительного мира и преодолеть свои собственные темные прошлые.