Рун Баллот - бедствующая проститутка-подросток, которая вынуждена проживать в жестоком Мардок Сити. Но однажды ее жизнь кардинально меняется, когда амбициозный менеджер казино по имени Шэлл предлагает ей нечто невероятное. Он дарит ей новую судьбу, фальшивую невинность и фальшивое прошлое, полностью изменяя ее жизнь.

Баллот испытывает глубокую благодарность по отношению к Шэллу, но пытается разгадать загадку его щедрости. Что побудило незнакомого человека сделать так много для нее? Чувствуя любопытство, она решает исследовать прошлое Шэлла через его компьютер. Но этот поступок оказывается судьбоносной ошибкой, которая меняет все ее представления о жизни.

Шэлл узнает о действиях Баллот и решает уничтожить ее, подложив взрывчатку в ее машину. Однако, в городе Мардок, где преступность достигает небывалых масштабов, вводится новый закон "Скрамбл". Он предоставляет полиции неограниченные полномочия по защите свидетелей и восстановлению правопорядка. Так полиция решает спасти Баллот, восстанавливая ее тело с помощью синтетических волокон. После пробуждения у Баллот появляется только одна цель - отомстить за свою новую жизнь.