В далеком будущем человечество покинуло разоренную и отравленную Землю, отправившись в космос в поисках нового дома. Однако, неожиданно для всех, планета оказалась непригодной для жизни. Единственным островом спасения стала Япония, остальные территории стали смертельно опасными.

Чтобы обеспечить жильем все население, были созданы специальные зоны вокруг Японии. Но в 1431 году произошло восстание в этих зонах, и они захватили саму Японию, разделив ее на феодальные вотчины и вытеснив коренное население. Сейчас, в 1648 году, выжившие беженцы живут на огромном городе-корабле, который непрерывно путешествует над пустынным континентом.

Возникают слухи о предстоящей войне и апокалипсисе, и реконструкция истории человечества останавливается на время, чтобы выяснить, что ждет их после 1648 года. В этой ситуации Тори Аой, руководитель академии Высшей Федерации и президент студенческого совета, собирает своих сокурсников, чтобы вернуть свою историческую родину и проложить путь к будущему, полному надежды и возможностей.