В великом городе Токио над губернатором нависла угроза. Злодей планирует совершить взрыв в туннеле метро, и только благодаря умению гения-детектива Конана предсказывать смертельные сценарии удается предотвратить катастрофу. Конан знает, что ключ к разгадке лежит в деревне, которую пришлось перенести из-за строительства дамбы. Он отправляется туда на поиски связи между преступником и этим местом.

В деревне Конану приходится применить все свои навыки и логическое мышление, чтобы раскрыть тайну. Он обнаруживает, что преступник пытается отомстить за то, что его родной дом был уничтожен из-за строительства дамбы. Теперь он готов совершить новую атаку, и только Конан может остановить его.

Начинается захватывающая гонка со временем. Конану предстоит разгадать загадки, раскрыть скрытые связи и собрать все фрагменты головоломки, чтобы найти преступника и помешать ему. Каждая новая подсказка приближает детектива к цели, но время на исходе. Сможет ли Конан справиться с мощным противником и спасти город от новой угрозы?